華大智造測(cè)序平臺(tái)探究菌群與人體代謝因果關(guān)系

原標(biāo)題:華大智能測(cè)序平臺(tái)探索菌群與人體代謝的因果關(guān)系。

華智造。照片由CFP提供

【深圳商報(bào)】(記者袁思茹)腸道菌群能幫你減肥嗎？1月3日，深圳華大生命科學(xué)研究院團(tuán)隊(duì)在《自然遺傳學(xué)》在線發(fā)表研究論文，探索植物區(qū)系與人體代謝之間的因果關(guān)系，發(fā)現(xiàn)了一批可能具有應(yīng)用前景的相關(guān)研究。

腸道菌群被稱為人體健康的“晴雨表”。隨著人類出生后的比較好口氣空氣和食物，它們進(jìn)入腸道和“營(yíng)地”。此后，這些微生物不斷擴(kuò)大隊(duì)伍，最終形成了穩(wěn)定的菌群。

腸道菌群數(shù)量龐大，與人的健康息息相關(guān)，比如會(huì)影響免疫、神經(jīng)、代謝、內(nèi)分泌甚至精神狀態(tài)。如何有效干擾菌群是科學(xué)家研究的核心問題之一。

該項(xiàng)目的負(fù)責(zé)人張濤博士說，孟德爾隨機(jī)分析***用于這項(xiàng)研究。“這是一種主要用于流行病學(xué)病因?qū)W推斷的數(shù)據(jù)分析方法，可以從基因水平追溯疾病的發(fā)生，在腸道菌群研究方面具有天然優(yōu)勢(shì)?！?/p>

據(jù)報(bào)道，該研究構(gòu)建了基因組與腸道菌群、基因組與血液代謝產(chǎn)物之間的關(guān)聯(lián)，并從各種腸道菌群中發(fā)現(xiàn)了微生物與人體健康指標(biāo)之間的一些相關(guān)性。比如微生物Alistipes和Oscillibacter有望降低人體內(nèi)甘油三酯的含量，甘油三酯是人體內(nèi)最豐富的脂質(zhì)；腸道菌群的果膠降解途徑會(huì)增加尿酸，降低孕酮水平；血液中葉酸和硒的水平可能抑制變形菌的生長(zhǎng)。這些發(fā)現(xiàn)為今后靶向菌群的干預(yù)和治療提供了指導(dǎo)。

隨后，團(tuán)隊(duì)利用開放數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行了雙樣本孟德爾隨機(jī)分析，進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)了菌群與各種疾病之間的因果信號(hào)。例如，變形桿菌(包括大腸桿菌)可以積極促進(jìn)二型糖尿病，充血性心力衰竭，結(jié)直腸癌和其他疾病。此外，研究小組還發(fā)現(xiàn)了可以影響結(jié)腸癌、癲癇、肺結(jié)核等疾病的腸道微生物。

這篇論文的比較好作者劉小敏博士提到，這項(xiàng)研究是比較好次基于來自單一人群的3432個(gè)樣本的多組學(xué)數(shù)據(jù)來探索和發(fā)現(xiàn)多種腸道微生物和代謝物之間的潛在因果關(guān)系。此外，探索腸道細(xì)菌與疾病之間可能的因果關(guān)系，為未來靶向菌群的***干預(yù)奠定了基礎(chǔ)。

值得一提的是，本次研究涉及的宿主基因組測(cè)序和微生物測(cè)序均由華大知止自主研發(fā)的測(cè)序平臺(tái)及其配套的自動(dòng)化制樣系統(tǒng)完成?；厮押嗫纯?。

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