華大智造測序平臺探究菌群與人體代謝因果關(guān)系

原標(biāo)題:華大智能測序平臺探索菌群與人體代謝的因果關(guān)系。

華智造。照片由CFP提供

【深圳商報】(記者袁思茹)腸道菌群能幫你減肥嗎？1月3日，深圳華大生命科學(xué)研究院團(tuán)隊(duì)在《自然遺傳學(xué)》在線發(fā)表研究論文，探索植物區(qū)系與人體代謝之間的因果關(guān)系，發(fā)現(xiàn)了一批可能具有應(yīng)用前景的相關(guān)研究。

腸道菌群被稱為人體健康的“晴雨表”。隨著人類出生后的第一口氣空氣和食物，它們進(jìn)入腸道和“營地”。此后，這些微生物不斷擴(kuò)大隊(duì)伍，最終形成了穩(wěn)定的菌群。

腸道菌群數(shù)量龐大，與人的健康息息相關(guān)，比如會影響免疫、神經(jīng)、代謝、內(nèi)分泌甚至精神狀態(tài)。如何有效干擾菌群是科學(xué)家研究的核心問題之一。

該項(xiàng)目的負(fù)責(zé)人張濤博士說，孟德爾隨機(jī)分析首次用于這項(xiàng)研究。“這是一種主要用于流行病學(xué)病因?qū)W推斷的數(shù)據(jù)分析方法，可以從基因水平追溯疾病的發(fā)生，在腸道菌群研究方面具有天然優(yōu)勢?！?/p>

據(jù)報道，該研究構(gòu)建了基因組與腸道菌群、基因組與血液代謝產(chǎn)物之間的關(guān)聯(lián)，并從各種腸道菌群中發(fā)現(xiàn)了微生物與人體健康指標(biāo)之間的一些相關(guān)性。比如微生物Alistipes和Oscillibacter有望降低人體內(nèi)甘油三酯的含量，甘油三酯是人體內(nèi)最豐富的脂質(zhì)；腸道菌群的果膠降解途徑會增加尿酸，降低孕酮水平；血液中葉酸和硒的水平可能抑制變形菌的生長。這些發(fā)現(xiàn)為今后靶向菌群的干預(yù)和治療提供了指導(dǎo)。

隨后，團(tuán)隊(duì)利用開放數(shù)據(jù)庫進(jìn)行了雙樣本孟德爾隨機(jī)分析，進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)了菌群與各種疾病之間的因果信號。例如，變形桿菌(包括大腸桿菌)可以積極促進(jìn)二型糖尿病，充血性心力衰竭，結(jié)直腸癌和其他疾病。此外，研究小組還發(fā)現(xiàn)了可以影響結(jié)腸癌、癲癇、肺結(jié)核等疾病的腸道微生物。

這篇論文的第一作者劉小敏博士提到，這項(xiàng)研究是第一次基于來自單一人群的3432個樣本的多組學(xué)數(shù)據(jù)來探索和發(fā)現(xiàn)多種腸道微生物和代謝物之間的潛在因果關(guān)系。此外，探索腸道細(xì)菌與疾病之間可能的因果關(guān)系，為未來靶向菌群的精準(zhǔn)干預(yù)奠定了基礎(chǔ)。

值得一提的是，本次研究涉及的宿主基因組測序和微生物測序均由華大知止自主研發(fā)的測序平臺及其配套的自動化制樣系統(tǒng)完成?；厮押嗫纯?。

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